短程分子蒸餾設備是在高真空條件下進行的，因此設備內要求具有較低的殘氣壓力，這就會帶來其他一系列的要求：

　　1、需要正確地選擇真空泵機組性能與管道尺寸，保障能夠快速地從容器內抽出氣體。

　　2、正確選擇蒸發面與冷凝面的形狀、距離與相對位置，保障從設備的蒸餾內無阻礙地引出殘余氣體。蒸發面與冷凝面之間的具體過小時，一方面不利于抽除氣體，另一方面蒸餾液的霧沫也易濺到冷凝面上，使分離效果變差。

　　3、多用于分離熱不穩定性物質，因此要求被加工的物料在蒸餾溫度下停留較短的時間。

　　4、液層內部的擴散是影響過程的重要因素。因此短程分子蒸餾設備應力求減少液層厚度及強化液層的位移，使之湍動。

　　其次就是被蒸餾的液體須預先除氣。因為在大氣壓下，無論何種液體都或多或少都會含有氣體。這些氣體的含量決定于液體本身的性質和它進入蒸餾裝置之前所處的狀態。因此未經除氣的液體不能直接加入短程分子蒸餾設備，否則不能保障系統的真空度。